vak: (Знайка)
[personal profile] vak
Ответ на настоящее время: 20421 штука.

Вот скрипт на Питоне, который извлекает из базы UniProt/SwissProt полный список известных протеинов человеческого организма: extract_human_swissprot_proteins.py

Результат записывается в файл human_swissprot_proteins.tsv. Для каждого протеина указывается идентификатор, описание и название гена. К примеру, отыщем всё, связанное с инсулином:
$ grep -i insulin human_swissprot_proteins.tsv
F8WCM5 Insulin, isoform 2 INS-IGF2
O00425 Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 3 IGF2BP3
O14654 Insulin receptor substrate 4 IRS4
O15503 Insulin-induced gene 1 protein INSIG1
P01308 Insulin INS
P01344 Insulin-like growth factor 2 IGF2
P05019 Insulin-like growth factor 1 IGF1
P06213 Insulin receptor INSR
P08069 Insulin-like growth factor 1 receptor IGF1R
P08833 Insulin-like growth factor-binding protein 1 IGFBP1
P09565 Putative insulin-like growth factor 2-associated protein N/A
P14616 Insulin receptor-related protein INSRR
P14735 Insulin-degrading enzyme IDE
P17936 Insulin-like growth factor-binding protein 3 IGFBP3
P18065 Insulin-like growth factor-binding protein 2 IGFBP2
P22692 Insulin-like growth factor-binding protein 4 IGFBP4
P24592 Insulin-like growth factor-binding protein 6 IGFBP6
P24593 Insulin-like growth factor-binding protein 5 IGFBP5
P35568 Insulin receptor substrate 1 IRS1
P35858 Insulin-like growth factor-binding protein complex acid labile subunit IGFALS
P51460 Insulin-like 3 INSL3
P61371 Insulin gene enhancer protein ISL-1 ISL1
Q01101 Insulinoma-associated protein 1 INSM1
Q14641 Early placenta insulin-like peptide INSL4
Q16270 Insulin-like growth factor-binding protein 7 IGFBP7
Q6B9Z1 Insulin growth factor-like family member 4 IGFL4
Q6U949 Putative insulin-like growth factor 2 antisense gene protein IGF2-AS
Q6UW32 Insulin growth factor-like family member 1 IGFL1
Q6UWQ7 Insulin growth factor-like family member 2 IGFL2
Q6UXB1 Insulin growth factor-like family member 3 IGFL3
Q86XT9 Insulin-like growth factor-binding protein 3 receptor TMEM219
Q8TDV5 Glucose-dependent insulinotropic receptor GPR119
Q8WX77 Insulin-like growth factor-binding protein-like 1 IGFBPL1
Q96A47 Insulin gene enhancer protein ISL-2 ISL2
Q96T92 Insulinoma-associated protein 2 INSM2
Q9NZI8 Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1 IGF2BP1
Q9Y4H2 Insulin receptor substrate 2 IRS2
Q9Y581 Insulin-like peptide INSL6 INSL6
Q9Y5Q6 Insulin-like peptide INSL5 INSL5
Q9Y5U4 Insulin-induced gene 2 protein INSIG2
Q9Y6M1 Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 2 IGF2BP2
А вот скрипт, показывающий структуру указанного протеина: get_protein_sequence.py. Опробуем на инсулине:
$ python3 get_protein_sequence.py P01308
Fetching protein sequence for UniProt accession: P01308
UniProt data retrieved for P01308: Insulin
Saved sequence to protein_sequences.fasta

$ cat protein_sequences.fasta
>P01308 | Insulin | UniProt Protein Sequence
MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGGGPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN
Каждая буква обозначает аминокислоту:
  • A - Аланин
  • C - Цистеин
  • D - Аспарагиновая кислота
  • E - Глутаминовая кислота
  • F - Фенилаланин
  • G - Глицин
  • H - Гистидин
  • I - Изолейцин
  • K - Лизин
  • L - Лейцин
  • M - Метионин
  • N - Аспарагин
  • P - Пролин
  • Q - Глутамин
  • R - Аргинин
  • S - Серин
  • T - Треонин
  • V - Валин
  • W - Триптофан
  • Y - Тирозин
vak: (Робот 1)
[personal profile] vak
Не заселить ли Луну и Марс роботами вместо людей? Смотрите, роботы уже кое-что нетривиальное могут.

Статья на сайте Boston Dynamics: "Large Behavior Models and Atlas Find New Footing"

Статья на сайте Toyota Research Institute: "A Careful Examination of Large Behavior Models for Multitask Dexterous Manipulation"

[personal profile] chabapok
Д - деградация. Сорри за видео с говноканала, но оно важное. Про то, почему война продолжается.

Российская мать уговаривает сына "просто надеть форму и отслужить 1 год"

argument_q: (lighthouse)
[personal profile] argument_q
машини для Айдару та інших підрозділів

https://youtu.be/ai0QCCUX3hI?si=0ySkWobL9wTu11KU

Ген вам

Aug. 20th, 2025 12:01 pm
vak: (Default)
[personal profile] vak
Общепринятого словаря генов пока нет, но существуют базы данных, откуда можно извлечь формулу нужного протеина. Вот к примеру скрипт на Питоне, показывающий структуру инсулина. Не забудьте поставить ваш email.
скрипт )
Запускаем:
результат )

Лабазюк

Aug. 20th, 2025 09:32 pm
ryativna_otruta: (Default)
[personal profile] ryativna_otruta
Вже завтра Рада голосуватиме за "захист друзів президента" від покарання за корупцію, - Шабунін
Рада хоче захистити друзів Зеленського від покарання за корупцію
21 серпня Верховна Рада розглядатиме законопроєкт, яке дозволить захищати посадовців від покарання за корупцію
https://censor.net/ua/n3569635

Госпредприятие "Проскуровка" на Хмельнитчине обвиняет нардепа Лабазюка в рейдерском захвате. ВИДЕО
https://censor.net/ru/v3569524
vak: (Default)
[personal profile] vak
Насмотрелись мы всяких ASCII и Unicode, табличками нас не удивишь. Но какая кодировка самая старая? Вы будете удивлены, но возникла она гораздо раньше, чем древние укры вышли из моря на сушу. Благодаря ей все мы живём на этой планете. Она перекодирует "буквы" наших генов в аминокислоты белковых молекул. Так выглядит таблица.



Как эта штука работает? Рассмотрим картинку.



"Буквы" нашей ДНК образованы парами аденинтимин (A-T) и гуанинцитозин (G-C). Каждая пара несёт два бита информации. Сначала ген считывается на промежуточную "перфоленту" - РНК. Такое считывание биологи называют транскрипцией. В процессе транскрипции тимин заменяется на урацил - видимо, для необратимости процесса.

Дальше перфолента (РНК) заряжается в рибосому - специальный станочек по производству белковых молекул. Буквы с РНК последовательно считываются, и для каждой буквы к создаваемому белку приклеивается следующая аминокислота. Это называется трансляцией. Буквы считываются группами по три штуки: биологи их называют кодонами. Три буквы по два бита - в сумме шесть бит - дают 64 комбинации. На выходе имеем 20 различных аминокислот. Кроме того, есть специальный стартовый кодон (AUG, превращающийся в метионин) и стоповые кодоны (три разных).

Отображение 64 кодонов в 20 аминокислот, плюс старт и три стопа - в этом вся суть "главной кодировки жизни". Если/когда мы обнаружим белковую жизнь в других мирах, с большой вероятностью кодировка окажется той же.

Вот та же таблица, но со ссылками на описания аминокислот.

1-е
основание
2-е основание3-е
основание
UCAG
UUUU(Phe) ФенилаланинUCU(Ser) СеринUAU(Tyr) ТирозинUGU(Cys) ЦистеинU
UUCUCCUACUGCC
UUA(Leu) ЛейцинUCAUAAСтопUGAСтопA
UUGUCGUAGСтопUGG(Trp) Триптофан    G
CCUUCCU(Pro) ПролинCAU(His) ГистидинCGU(Arg) АргининU
CUCCCCCACCGCC
CUACCACAA(Gln) ГлутаминCGAA
CUGCCGCAGCGGG
AAUU(Ile) ИзолейцинACU(Thr) Треонин        AAU(Asn) АспарагинAGU(Ser) СеринU
AUCACCAACAGCC
AUAACAAAA(Lys) ЛизинAGA(Arg) АргининA
AUG(Met) МетионинACGAAGAGGG
GGUU(Val) ВалинGCU(Ala) АланинGAU(Asp) Аспарагиновая кислотаGGU(Gly) ГлицинU
GUCGCCGACGGCC
GUAGCAGAA(Glu) Глутаминовая кислотаGGAA
GUGGCGGAGGGGG
lion_casserole: (Default)
[personal profile] lion_casserole
Re: “Was it a good move for Donald Trump to roll out the red carpet for Vladimir Putin in Alaska?”

Not at all.

Decent people don't invite criminals into their homes. If Trump wanted to give Putin, an internationally recognized war criminal, a chance to boost his self-esteem, he should have done so on foreign/neutral territory.

Trump did not use the opportunity to meet Putin in, let’s say, Turkey.

Surprisingly, European politicians decided to meet with Trump in the US. Ideally, they should have declined to visit a country that honors a war criminal. Wasn’t it possible for them to meet in, let’s say, Canada?

-----------------

Если у вас есть желание но нет возможности ответить вопрошавшему персонажу лично, вы можете оставить свой ответ в комментариях. Желательно сразу на английском языке, но можно на украинском или на русском. Постараюсь перевести и опубликовать стоящие ответы на сайте ( Quora dot com ), где иностранцы и тролли задают подобные вопросы.
[personal profile] chabapok
Ахахах - https://t.me/nexta_live/101286

"Сейчас правоохранительные органы пытаются установить личности участников. В съёмке, вероятно, участвовали семинаристы"
vak: (Бодхидхарма)
[personal profile] vak
Пять практик от Ивана Бодхидхармы.

1. Прямое проникновение в истинную природу задачи: Доверяйте своим инстинктам и глубоко вникайте в суть проблемы. Вместо того, чтобы чрезмерно полагаться на руководства, медитируйте о предназначении кода — проводите время в тишине, набрасывая решения или занимаясь отладкой, ища элегантные, оригинальные решения.

2. Сосредоточенные сеансы кодирования: Проводите длительную медитацию на критические блоки кода. Выделите время, чтобы «созерцать код», не отвлекаясь, чтобы достичь состояния потока. Это могут быть 90-минутные сеансы без отвлечений, способствующие глубокой концентрации для оттачивания алгоритмов или архитектуры.

3. Отказ от догм: Отбросьте приверженность к популярным фреймворкам или лучшим практикам. Экспериментируйте с минималистичными инструментами или индивидуальными решениями, создавая лёгкие приложения, в которых во главу угла ставится функциональность, а не раздутые зависимости.

4. Разум как сущность: Ясный ум — залог качественного кода. Практикуйте техники осознанности — короткие дыхательные упражнения — чтобы справляться со стрессом и избегать поспешных, ошибочных коммитов. Состояние ума определяет надёжность программного обеспечения.

5. Передача без слов, или код как коан: Обучайтесь и обучайте на примерах, а не на многословной документации. Делитесь сложными, но эффективными фрагментами кода (например, однострочным решением сложной задачи) как коанами, чтобы коллеги могли их обдумывать и адаптировать, способствуя совместному решению проблем и пониманию.
argument_q: (lighthouse)
[personal profile] argument_q
Голова Єврокомісії Урсула фон дер Ляєн,

канцлер Німеччини Фрідріх Мерц,

президент Фінляндії Александер Стубб,

премʼєрка Італії Джорджа Мелоні

та президент Франції Еманюель Макрон

візьмуть участь у зустрічі президента Володимира Зеленського і Дональда Трампа у Вашингтоні у понеділок, 18 серпня


https://censor.net/ua/n3569084
argument_q: (ukrainian girl)
[personal profile] argument_q
Єврокомісар з питань оборони та космосу Андріюс Кубілюс назвав єдиною першопричиною військової агресії Росії проти України "сам авторитарний та агресивний режим Путіна".

"Путін повторює, що зупинить війну проти України, якщо буде досягнуто згоди "про усунення всіх першопричин конфлікту". Путіну потрібно пам’ятати, що єдиною "першопричиною" агресії Росії проти України є сам авторитарний та агресивний режим Путіна", - йдеться в дописі

https://censor.net/ua/n3569017
argument_q: (lighthouse)
[personal profile] argument_q
https://censor.net/ua/n3569037

репутація... повага... надійність...
до тромба в Америки шось таке було...
колись...
vak: (Аристипп)
[personal profile] vak
Франсис Пикабиа. Младенец карбюратор. 1919г.

Позорище

Aug. 16th, 2025 12:15 pm
vak: (U.S.A.)
[personal profile] vak
Представляете какая трагедия для этих американских солдатиков.
Они пошли в армию, чтобы родине служить.
А им приказали стелить красную дорожку для хуйла.

(отсюда)

фейки, знову фейки

Aug. 16th, 2025 03:10 pm
argument_q: (armed forces of ua)
[personal profile] argument_q
Двоє окупантів зняли постановочне відео про нібито "захоплення" с.Андріївка-Клевцове та потрапили у полон, - ГУР. ВIДЕО
Російська пропаганда активно застосовує нову тактику поширення дезінформації - постановочні "захоплення" населених пунктів для створення ілюзії успіхів на фронті
https://censor.net/ua/v3568927


*

Більше про обстріли України за посиланням --- https://censor.net/ua/tag/1983/obstril


Окупанти вдарили по цивільній інфраструктурі центральної частини Сумської громади: спалахнула пожежа
https://censor.net/ua/v3568853

Росіяни атакували ракетами Дніпровський район: один загиблий та один постраждалий. ФОТО
https://censor.net/ua/p3568843

Доба на Дніпропетровщині: одна людина загинула, троє дістали поранення
https://censor.net/ua/p3568973


Через високу щільність та активність ворожих FPV-дронів Куп’янськом практично неможливо пересуватися
https://censor.net/ua/n3568672

Ворог продовжує тиснути на Куп’янському напрямку, зафіксована активність ДРГ
https://censor.net/ua/n3568955



*

Депутатка з поплічниками привласнила 92 га землі на Київщині, - Офіс генпрокурора
https://censor.net/ua/n3568947


*

Сили оборони знищили систему РЕБ, гармату, польовий склад боєприпасів, антени зв’язку, укриття з піхотою. ВIДЕО
https://censor.net/ua/v3568984

Бійці Нацполіції провели операцію на Торецькому напрямку: один окупант застрелився, другий - здався в полон. ВIДЕО
https://censor.net/ua/v3568981

На Південному напрямку фронту прикордонники Бердянського загону атакували техніку ворога, зокрема транспортні засоби противника
https://censor.net/ua/v3568958

Бійці Прикордонного підрозділу безпілотних авіаційних систем "Фенікс" ліквідували російських загарбників ударами дронів-камікадзе
https://censor.net/ua/v3568964


Артсистеми, танки та бронетехніка: Сили безпілотних систем уразили впродовж доби 829 цілей ворога. ІНФОГРАФІКА
https://censor.net/ua/n3568871

Загальні бойові втрати РФ від початку війни - близько 1 069 050 осіб (+1010 за добу), 11 112 танків, 31 540 артсистем, 23 135 бойових броньованих машин. ІНФОГРАФІКАhttps://censor.net/ua/n3568916



*

Полонений окупант під час зачистки позицій: "Я немножко сейчас в ах#е". ВIДЕО
Бійці 1-ої роти "Warriors Cartel" 2-го МехБату оприлюднили кадри штурмових дій, на яких видно, як вони просуваються вглиб ворожих позицій, зачищають бліндажі та беруть у полон окупантів
https://censor.net/ua/v3568905

Полонені росіяни розповіли про провал наступу на Покровськ та нелюдські порядки в армії РФ. ВIДЕО
https://censor.net/ua/v3568904



*

Дрони атакували Самарську область: пожежа на НПЗ у Сизрані. ВІДЕО
https://censor.net/ua/p3568733

У Генштабі підтвердили ураження Сизранського НПЗ та пункту управління на ТОТ Донеччини
https://censor.net/ua/n3568766

Сили оборони уразили морський порт "Оля" в Астраханській області РФ
https://censor.net/ua/n3568740

Уражено Волгоградський НПЗ, на заводі сильні пожежі
https://censor.net/ua/n3568619


Понад 4% ВВП втратила РФ від початку року внаслідок ударів Сил оборони, - Генштаб ЗСУ. ІНФОГРАФІКА
https://censor.net/ua/n3568745

Profile

sparkmann: Yellow_star_Jude_Jew (Default)
sparkmann

November 2022

S M T W T F S
  12345
67 89101112
13141516171819
20212223242526
27282930   

Most Popular Tags

Page Summary

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Aug. 22nd, 2025 06:30 am
Powered by Dreamwidth Studios